"एनआईईआर: ऑटोमेटा" का शुरुआती अध्याय खिलाड़ियों को मिशन 2बी की शुरुआत में ले जाता है। एक बार जब आप अपनी उड़ान इकाई को उतार देते हैं और हाथापाई हथियारों से लड़ना शुरू कर देते हैं, तो आप एक हाथ वाली तलवार और दो हाथ वाली तलवार तक पहुंच प्राप्त कर लेते हैं।
यह दो हाथ वाली तलवार पवित्र तलवार है, एक बहुत शक्तिशाली हथियार जिसे आप प्रस्तावना के बाद थोड़ी देर के लिए खो देंगे। हालाँकि अब हथियार खो सकता है, आप अगले अध्याय पर आगे बढ़ने के लिए फ्री रोम को तुरंत अनलॉक करने के बाद इसे किसी भी समय पुनः प्राप्त कर सकते हैं।
यह पहला अतिरिक्त हथियार है जिसे आप खेल में प्राप्त कर सकते हैं यदि आप सीधे वहां जाते हैं, और यह उस स्थान से बहुत दूर नहीं है जहां आप पहली बार कवर छोड़ने और सतह पर पहुंचने के बाद दिखाई देते हैं। एक बार जब आप शहर के खंडहरों में उतरते हैं और निचले क्षेत्र में कूदते हैं, तो अपनी बाईं ओर देखें और आपको निकटतम पहुंच बिंदु के ठीक ऊपर एक राजमार्ग दिखाई देगा। राजमार्ग के सामने की ओर जाएँ, चढ़ने के लिए मलबे पर कूदें और राजमार्ग के मुख्य पथ पर दौड़ें। ऐसा करने से आप वापस वहीं पहुंच जाएंगे जहां फैक्ट्री है।
फ़ैक्टरी पर जाएं और मुख्य भवन की ओर घास वाले रास्ते का अनुसरण करें। बाईं ओर छिपा हुआ एक और प्रवेश बिंदु है, साथ ही ऊपरी स्तर तक जाने वाली सीढ़ियों का एक सेट भी है। ऊपरी क्षेत्र में, बाईं ओर देखें और आप नष्ट हुए पुल को देखेंगे जहां आपने विशाल आकार के दुश्मन से लड़ाई की थी। नष्ट हुए पुल के किनारे तक दौड़ें और आपको पवित्र तलवार जमीन में फंसी हुई मिलेगी, जिसे उठाकर ले जाया जा सकता है।
तलवार के ठीक दाईं ओर आपका पुराना शरीर है, जिसे आप प्रस्तावना से सभी उपभोग्य सामग्रियों को वापस पाने के लिए लूट भी सकते हैं।
अधिकांश दो-हाथ वाले हथियारों की तरह, यह तलवार व्यापक क्षेत्र के हमलों पर ध्यान केंद्रित करती है जो धीमी समग्र हमले की गति के बावजूद, कई दुश्मनों को भारी नुकसान पहुंचा सकती है। अपग्रेड के साथ, इस हथियार की क्षति क्षमता खेल में सबसे अधिक हो सकती है, जब तक आप इसकी धीमी हमले की गति के अभ्यस्त हो सकते हैं। आप तेज़ हथियार से लड़ते समय क्रिटिकल हिट का उपयोग करके इस दो-हाथ वाले हथियार को दूसरे हथियार के साथ भी जोड़ सकते हैं। यह आपको इस हथियार के साथ पूर्ण कॉम्बो नहीं देता है, बल्कि इसकी धीमी हमले की गति को पूरा करने के लिए तेज कॉम्बो में हमलों के छोटे विस्फोट देता है, लेकिन फिर भी इसकी उच्च क्षति का लाभ उठाता है।